Групповой анализ фенотипа при самопроизвольных преждевременных родах идентифицирует потенциальные ассоциации среди механизмов преждевременных родов
Цель
Мы хотели применить инновационный способ, который основывается на общих биологических путях, чтобы идентифицировать специфические фенотипы среди женщин со спонтанными преждевременными родами, чтобы усилить способность исследователей идентифицировать и подчеркнуть общие механизмы и лежащие в основе генетические факторы, ответственные за самопроизвольные преждевременные роды.
Ход исследования
Мы выполнили вторичный анализ проспективного многоцентрового исследования случай-контроль самопроизвольных преждевременных родов. Во всех случаях родились недоношенные дети в результате самопроизвольных преждевременных родов в сроке ≤34 недель гестации. Каждая женщина была исследована на наличие причин, лежащих в основе спонтанных преждевременных родов. Иерархический групповой анализ был использован, чтобы идентифицировать группы женщин с гомогенными фенотипическими профилями.
Результаты
У 128 женщин с самопроизвольными преждевременными родами были описаны фенотипы. Иерархическая группировка фенотипов выявила 5 главных групп. Кластер 1 (количеством 445) характеризовался материнским стрессом; кластер 2 (количеством 294) - преждевременным разрывом плодных оболочек; кластер 3 (количеством 120) был охарактеризован семейными факторами и кластер 4 (количеством 63) включал материнскую сопутствующую заболеваемость. Кластер 5 (количеством 106) был многофакторным и охарактеризовался инфекцией , децидуальным кровотечением и плацентарной дисфункцией. Эти три фенотипа коррелировали в хи-квадрат анализе (дисфункция плаценты и децидуальное кровотечение, статистическая значимость (Р ) < 2,2е-6; дисфункция плаценты и инфекция, Р=6,2е – 10; инфекция и децидуальное кровотечение (Р=0,0036)). Генный анализ идентифицировал ген инсулина, как значительно ассоциированный с кластером 3 при самопроизвольных преждевременных родах.
Заключение
Мы идентифицировали 5 главных кластеров преждевременных самопроизвольных родов, основываясь на иерархической группировке фенотипов. Существовала значительная корреляция между несколькими фенотипами. Ген инсулина был ассоциирован с семейными факторами, которые лежали в основе преждевременных самопроизвольных родов.
Ключевые слова
групповой анализ, генный анализ, фенотип, спонтанные преждевременные роды
Cluster analysis of spontaneous preterm birth phenotypes identifies potential associations among preterm birth mechanisms
M. Sean Esplin, MD, Tracy A. Manuck, MD, Michael W. Varner, MD, Bryce Christensen, PhD, Joseph Biggio, MD, Radek Bukowski, MD, PhD, Samuel Parry, MD, Heping Zhang, PhD, Hao Huang, MD, MPH, William Andrews, MD, George Saade, MD, Yoel Sadovsky, MD, Uma M. Reddy, MD, MPH, John Ilekis, PhD
American Journal of Obstetrics & Gynecology
September 2015Volume 213, Issue 3, Pages 429.e1–429.e9
Key words:
cluster analysis, gene-based analysis, phenotype, spontaneous preterm birth